在史籍上關(guān)于忍者活動(dòng)的最后記載，是1637年的“島原之亂”，忍者作為幕府的部下參與了這場戰(zhàn)斗。

忍者的工作其實(shí)很多，主要是為主君進(jìn)行秘策、破壞、暗殺、收集敵方前線情報(bào)、攪亂敵方后援基地等種種諜報(bào)活動(dòng)。所以后世很多人認(rèn)為，忍者是間諜的鼻祖。

忍者在世時(shí)必須隱姓埋名，與黑暗為伍，也不能留下只言片語，以免日后東窗事發(fā)。因此，關(guān)于忍者的歷史記錄寥寥無幾，只發(fā)現(xiàn)忍術(shù)秘本中記錄了圣德太子身邊的一位忍者，忍者的起源至今也沒有人說得清楚。