孫耀琦年幼時，家道尚且殷實。

不過當(dāng)時江南流行結(jié)黨，復(fù)社學(xué)子到處抓人入社，宣講經(jīng)義。

孫耀琦無心結(jié)黨，又因此遭受復(fù)社報復(fù)，無法專心研究，便與父母商議后決定遷居長安虎丘山畔。

據(jù)說這個孫耀琦自幼聰穎異常，十三歲時歲即考入?yún)墙h鄉(xiāng)學(xué)，人稱神童......

錦衣衛(wèi)還查到，他不僅研究古史經(jīng)驗，從西方傳入的數(shù)學(xué)知識，探討測量、算指、幾何之法更是他主要學(xué)習(xí)的方向。