四月初六萬歷皇帝將徐紹吉、韓浚等人的彈劾奏疏下發(fā)內閣，方從哲立刻上本罷免翁正春等人，最終，圣旨決定翁正春、孫慎行、朱國禎三人回籍調理（等于變相免職），王圖冠帶閑?。饴毑涣T官，保留政治待遇），喬允升、王之寀免職（貶為平民），惟獨東林色彩不太濃厚的孫瑋被留用。

接著，吏部施展明升暗降的手段，將江西道御史孫居相外調江西參政，吏科給事中姚永濟外調湖廣參議副使，山東道御史李邦華外調山西參議，兵科給事中熊明遇外調福建僉事，至此朝中東林黨的勢力一掃而空，三黨在丁巳京察中獲得最后的勝利······