正如朱由崧所料的，當(dāng)知道《商報(bào)》和其他轉(zhuǎn)載小報(bào)把倪元璐對(duì)自己的吹捧公諸于世，并針對(duì)性的解釋了自己與倪元璐的關(guān)系后，士林中開(kāi)始有人質(zhì)疑黃道周的人設(shè)了，在這種情況下，黃道周便只能選擇稱(chēng)病辭職以證清白。

只是黃道周并不愿意就這么灰溜溜的離開(kāi)政治舞臺(tái)，所以，他臨走時(shí)還耍了個(gè)把戲，向崇禎皇帝上疏上說(shuō)什么：小人被任用，掌握權(quán)柄，實(shí)則懷揣著違犯圣上命令的逆心，所以導(dǎo)致士人和普通百姓跟皇上都不是一條心，兵匪劫掠侵奪的禍亂發(fā)生，天下動(dòng)蕩不安，禮樂(lè)升平的景象一去不復(fù)返。