在諸侯拼上全力后，起義軍果然支持不住，這不，崇禎十年十二月二十三日，小倉藩和中津藩以傷亡150人的代價，奪取了四阿山砦，守備四阿山砦的島原百姓350人，全軍覆沒；兩天后，石岡藩和柳河藩也以180人傷亡為代價奪取了南崩山砦，并殺死了山砦中的300男女百姓；至此島原城的支城全部陷落，守軍陷入了孤立無援的境地。