建炎二年，金兵一路南下追討趙構，金人兵臨揚州，呂頤浩讓趙構速速渡江，自己留在揚州抵抗。此事后，趙構當即擢升其為簽書樞密院事、江淮兩浙制置使。建炎三年，苗劉兵變，他聯系援軍并且威懾叛軍，幫助趙構復辟，此事過后，呂頤浩拜相。

當年九月金兵渡江南下，搜山檢海捉拿趙構，同樣是呂頤浩再度站出來，先表示愿意死守常州一線，而后又給趙構獻上‘浮海之計’。